Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap23O09044 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms