Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube3aO08759 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms