Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MttpO08601 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MttpO08601 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MttpO08601 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms