Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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