Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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