Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2056J3QQ02 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms