Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gm8356J3QPD3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gm8356J3QPD3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gm8356J3QPD3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8356J3QPD3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm8356J3QPD3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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