Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms