Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20918J3QN17 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20918J3QN17 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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