Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms