Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3415J3QMS8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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