Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms