Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgef1G3X9K3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms