Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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