Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Igkv1-99F6XWB2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms