Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm42421F6X8D5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms