Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms