Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms