Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd1E9PZ26 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brd1E9PZ26 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms