Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp839E9PUU5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp839E9PUU5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms