Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms