Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf217D3YYI7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Rnf217D3YYI7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnf217D3YYI7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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