Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rfx8D3YU81 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rfx8D3YU81 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfx8D3YU81 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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