Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20547B8JJN0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms