Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms