Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Grik3B1AS29 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik3B1AS29 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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