Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms