Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn3aA2ASI5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn3aA2ASI5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn3aA2ASI5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn3aA2ASI5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn3aA2ASI5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn3aA2ASI5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn3aA2ASI5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn3aA2ASI5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn3aA2ASI5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn3aA2ASI5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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