Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rtf1A2AQ19 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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