Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms