Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel3A2AHA7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms