Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34dA2AGU5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34dA2AGU5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms