Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms