Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms