Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms