Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ubl3Q9Z2M6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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