Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Robo3Q9Z2I4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Robo3Q9Z2I4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Robo3Q9Z2I4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Robo3Q9Z2I4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Robo3Q9Z2I4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Robo3Q9Z2I4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Robo3Q9Z2I4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Robo3Q9Z2I4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms