Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms