Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms