Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nfs1Q9Z1J3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfs1Q9Z1J3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms