Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Clip2Q9Z0H8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Clip2Q9Z0H8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip2Q9Z0H8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Clip2Q9Z0H8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Clip2Q9Z0H8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Clip2Q9Z0H8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Clip2Q9Z0H8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Clip2Q9Z0H8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Clip2Q9Z0H8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip2Q9Z0H8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms