Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp1a4Q9WV27 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms