Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod3Q9R0E1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms