Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nek3Q9R0A5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms