Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms