Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms