Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nectin3Q9JLB9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nectin3Q9JLB9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nectin3Q9JLB9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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