Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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