Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp5Q9JKD3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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