Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms